En hoteles puede elegir entre grandes cadenas hoteleras y los tradicionales "ryokan", hoteles de estilo japonés.

La mayoría de cadenas hoteleras internacionales están asentadas también en las grandes ciudades de Japón. Para mayor seguridad en su elección puede optar por uno de los 260 hoteles de la Japan Hotel Association (JHA).
Los servicios que se ofertan son los mismos que los de cualquier establecimiento hotelero occidental: baño, calefacción, televisión piscina...

Si prefiere inmiscuirse en lo más profundo de la tradición japonesa una buena elección puede suponer decantarse por alojarse en un "ryokan".

Una descripción general de un "ryokan" típico estaría compuesta por habitaciones sin paredes, con puerta corredera ("shoji"), en las que el suelo está conformado por un "tatami" hecho de paja de arroz. Como único mobiliario que se ofrece, una mesita baja y por la noche las camareras de habitaciones desplegarán en la habitación un "futón" para dormir.

El servicio de media pensión suele incluir desayuno y cena, que por regla general son servidos en las habitaciones. Por otro lado, es conveniente conocer ciertas reglas de cortesía inusuales en Occidente a la hora de alojarse en estos lugares. Es necesario descalzarse a la entrada para para desplazarse por el establecimiento con unas zapatillas que pondrán a nuestra disposición y que, a su vez, deberán dejarse en la puerta de la habitación para evitar daños sobre el "tatami". Además, para acceder al baño común será obligatorio antes usar el baño privado.

Una variante atractiva es el "onsen", un "ryokan" construido alrededor de una fuente termal.